el 1487, alla morte del Re, la sottomissione alla Spagna si aggravò con l'arrivo del tribunale di inquisizione. L'intolleranza nei confronti delle minoranze non cristiane rese inutile i fermenti culturali che da sempre avevano contraddistinto la Sicilia. Le due insurrezioni del 1510 e 1525, non portarono nessun cambiamento, L'aristocrazia era troppo divisa per sperare di opporsi alla corona Spagnola. Il popolo non aveva ideali sociali ben definiti. la scoperta dell'America nel 1492, e delle altre rotte continentali, ridusse notevolmente l'importanza dell'isola del commercio del vecchio mondo. Il periodo che segui' fu denso di eventi drammatici, le furbizie dei pirati saraceni; i briganti dell'entroterra, le due fallite insurrezioni contro il governo a Palermo e a Messina, e il tremendo terremoto del 1693 che colpi' il sud dell'isola. Una lapide muraria nella porta di terra, (porta Spagnola) ricorda questi lavori. Regnando Carlo II Re di Spagna e di Sicilia, il Vicere' di Sicilia Don Francesco Benavides, conte di Santo Stefano, volle fortificare il litorale di questo porto a difesa non solo della Sicilia ma di tutta l'Italia e della cristianità, correva l'anno 1681.